正確的色譜柱存儲對于正確的色譜和延長色譜柱壽命至關重要。

正相色譜柱應儲存在異辛烷/乙醇中。

反相固定相應保存在水/有機改性劑（乙腈/甲醇）的混合物中，不含任何可能在儲存過程中沉淀的緩沖液或添加劑。 因此，建議在周末停止色譜時清洗色譜柱，即使色譜柱未與系統斷開連接，尤其是在長期存放時也是如此。 至少 5-10% 的有機含量是必要的，以避免**/藻類生長。 通常建議將反相色譜柱存放在至少 50-70& 甲醇/乙腈和水中。

從系統上拆下色譜柱，并使用專門設計的色譜柱端塞關閉色譜柱入口和出口。 色譜柱應在室溫下存放在原包裝盒中，并附上分析證書的副本以備將來使用，并在將來使用前對色譜柱進行評估。